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甲基化檢測:DNA重亞硫酸鹽快速轉化
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時間: 2023-04-18 | 3063 次瀏覽 | 分享到:

表觀遺傳學是研究在基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達和調控的可遺傳變化的一門遺傳學分支學科。表觀遺傳的現象很多,比如RNA介導的基因沉默,組蛋白修飾,DNA甲基化等。其中,DNA的甲基化作為高等真核生物中一個主要的表觀遺傳學機制,被廣泛研究。

近年來涌現出很多 DNA 甲基化的檢測技術,常用的DNA甲基化檢測方式主要是基于亞硫酸鹽修飾預處理的甲基化檢測技術。

(重亞硫酸鹽轉化原理)

天根生化針對DNA甲基化研究中的DNA重亞硫酸鹽轉化開發(fā)一款全新試劑盒。

DNA重亞硫酸鹽快速轉化試劑盒(離心柱型)(DP225)

簡單快速:轉化和純化流程可在2 h內完成,對儀器設備要求較低,操作簡便。

轉化率高:DNA樣品中未甲基化胞嘧啶轉化為尿嘧啶的轉化率可達99.5%以上。

反應靈敏:DNA樣品適用濃度范圍在500 pg~2.5 μg之間。

完整度高:處理后的DNA完整度好,得率高。

普適性好:本試劑盒處理后的DNA樣品適用于甲基化特異性PCR,測序法及芯片法等后續(xù)甲基化分析方法。


實驗流程

重亞硫酸鹽轉化

1. Bisulfite Mix-L3干粉溶解

2. 重亞硫酸鹽反應體系配制

3. 重亞硫酸鹽轉化循環(huán)條件


表1重亞硫酸鹽反應體系

表2重亞硫酸鹽轉化循環(huán)條件

重亞硫酸鹽處理后的 DNA純化

DP225  實驗案例一

轉化時間和轉化試劑體積對轉化率的影響


DNA重亞硫酸鹽轉化試劑盒轉化率評估實驗流程

重亞硫酸鹽轉化循環(huán)條件

轉化時間和轉化試劑體積對轉化率的影響

實驗結論:

用天根DNA重亞硫酸鹽快速轉化試劑盒DP225轉化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比較了不同轉化試劑體積(100 μl和120 μl)和不同轉化時間(50 min (2 cycles), 75 min (3 cycles)和100 min (4 cycles))對轉化率的影響,轉化率通過NGS方法評估(流程見上表)。結果顯示,轉化試劑體積為120 μl時,相比100 μl得到更高的轉化率;轉化時間為100 min (4 cycles)時 ,相比于更短的轉化時間(50 min (2 cycles)和75 min (3 cycles)),得到更高的轉化率。


DP225  實驗案例二


不同品牌的同類產品轉化率比較

DNA重亞硫酸鹽轉化試劑盒轉化率評估實驗流程

不同品牌的DNA重亞硫酸鹽轉化試劑盒的轉化率比較


實驗結論:

用天根DNA重亞硫酸鹽快速轉化試劑盒DP225和國際主流品牌同類產品轉化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比較各產品的轉化率,轉化率通過NGS方法評估(流程見上表)。結果顯示,DP225具有高的轉化率,性能與國際品牌相當甚至更優(yōu)。


重亞硫酸鹽轉化后的下游分析


PyroSequencing焦磷酸測序

Sanger測序

建庫測序、捕獲測序、芯片、panel

甲基化特異性PCR-EM101

高分辨率熔解曲線分析-FP210

探針法qPCR-FP211,FP206 


訂購信息

產品名稱

貨號

規(guī)格

DNA重亞硫酸鹽快速轉化試劑盒

DP225

50次







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